姐妹互换

　　科学家们在一个小镇的供水系统中下毒，把居民变成杀人狂魔，他们互相残杀，任何人都能通过。

在外星人入侵几乎灭绝人类的几年后，人类难民在月球上的一个秘密基地，三个英雄决定跳入时间旅行，不顾一切地试图拯救幸存者，但他们不知道哨兵正在等待他们。

“解决专家”衣然英俊遇到罗师傅上门求助，罗师傅因跌打油遭诬告，其妹双双、盈盈为帮兄私自参加高颜奖金选美。衣然英俊携老孙、罗师傅追至赛场，与罗妹及中国选手徐菲组队，闯丛林、破庙宇机关，最终揭穿比赛的阴谋，助罗师傅渡过难关。

 以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。